高精度的3C组装
Meta Hi-C作为噬菌体与宿主互作研究利器,能将Hi-C与传统的宏基因组技术结合并进行测序,并进行后续生信分析。由于Hi-C可以直接测量生物体内同一细胞中存在的DNA序列,因此还可以对移动元素(如质粒、噬菌体和抗生素耐药性基因)进行宿主归属分析。相比已经公开的ProxiPhage分析方法仅仅在单菌组装上进行提升,基因帮Meta Hi-C在初步组装的病毒序列基础上,采用基于Hi-c分箱方法对噬菌体序列作进一步组装提升。并根据细菌分箱及噬菌体分箱的结果来分析噬菌体-细菌互作。
流程软件及数据库
核心优势
核心分析流程
输出结果
1)自主Hi-c分析流程:MetaHi-C V1.0;
2)分析软件:hic-qc、matlock、annotation_mover、CheckV、ViralCC等;
3)注释数据库:NT库、nr蛋白库。