常见问题

病毒组常见问题

使用核酸检测采样管采集的样本可以做病毒组吗?

能。但不能再做病毒富集。核酸检测采样管通常包含病毒灭活试剂,灭活后病毒裂解,无法再进行病毒颗粒的富集。即使是非灭活的病毒采样管,也无法确定其中的成分是否会影响后续实验,因此不推荐使用。

特殊样本,客户可以定制病毒分离方法吗?

可以。我们实验室可以根据客户样本情况设计优化实验方。

病毒组研究中,需要同时进行宏基因组或者16S关联分析,基因帮能提供吗?

可以。我们提供全套实验和分析解决方案,根据研究方案可以分离提取宏基因组和病毒组核酸,分别进行宏基因组建库和病毒组建库,并测序分析。

病毒组测序分析完成后,需要进行后续的验证服务,基因帮能提供吗?

可以。基因帮会根据项目设计和实验室的通量确定,不保证所有项目都能提供后续服务,这部分服务会另收费。

珍稀样本如何降低实验风险?

珍稀样本建议尽可能保存备份,避免反复冻融。我们在收到样品后,会先选取样本量较大的样品,取部分样品进行预实验,然后根据预实验的结果确定最优的实验条件。在此基础上对其他样本进行病毒组核酸提取和建库。同时我们在条件允许的情况下,也会尽可能保留备份,保证每个样品都能获得可靠的病毒组数据。

一般病毒组的相关研究每一组需要多少样本合适?

样本数根据样本收取的难易程度不同而不同,样本数量越多越能降低个体差异对后续分析的影响。通常来说每组样品30-50例能够满足普通的研究需要。对于某些特殊项目,一般来说最少也不能低于每组10个样品。

关注某一个病毒,但是无法从宿主体内分离培养,可以通过病毒组测序技术获得该病毒的基因组序列吗?

病毒组测序最大的优势就在于无需通过传统的病毒培养即可获得样品中的病毒核酸序列。尤其对于样品中丰度较高的病毒或者在宿主中活跃复制的病毒,我们很可能通过病毒组测序获得其全长基因组序列。

病毒组样本保存有什么特别需要注意的地方吗?

病毒组样本采集和保存与宏基因组不同,我们不建议采用任何商售的核酸保护液保存样品。建议拭子样品置于400-600μl PBS或生理盐水中,并冻存于- 80 ℃冰箱 ,组织样品无需加保护剂,清理干净后直接冻于- 80℃冰箱即可。

样本邮寄需要什么保存条件?常温?冰袋还是干冰?

冻存样品都需要用干冰寄送,详见采样及寄送指南。如遇特殊情况,请咨询我司。

病毒组样本在进行去宿主的实验时会损失胞内病毒吗?

不会。基因帮在去宿主富集病毒的过程中会裂解宿主细胞释放病毒,但不会破坏病毒颗粒的蛋白结构,因而不会损失已经包装好的胞内病毒。