专业的病毒组分析
宏病毒组作为一个继宏基因组之后新兴的分支研究组学,由于人们对其重要性认知较晚,以及缺乏成熟固定的研究技术和分析方法,因此在生信分析上也存在诸多挑战。通过与科研院所及医院多年合作,针对不同类型样本,我们研发了多种分析流程及数据库。
流程软件及数据库
核心优势
核心分析流程
输出结果
1)自主病毒分析流程:DNA病毒组pipeline, RNA病毒组pipeline, 全病毒组pipeline等;
2)主流病毒鉴定软件:DeepVirFinder、VIBRANT、Phigaro、VirSorter、CheckV等;
3)多套权威病毒数据库及模型:使用最新的开源数据库,如病毒NT库(45万病毒基因组)、病毒nr蛋白库(698万个病毒蛋白)、GBV(整合RVDB和inphared库,包含1700万个病毒蛋白)等以及PFAM、VOG、PVOG、RdRpBin等HMM模型。