数据质控
去除低质量及接头序列
去除宿主及rRNA序列
宏转录组
宏转录组学相对宏基因组学来讲，主要是在整体水平上研究某一特定环境、特定时期群体生物中所有微生物基因组的转录情况以及转录调控规律的学科。
产品与服务
普通宏转录组测序分析
互作转录组测序分析
产品介绍
应用方向
案例解析
宏转录组测序分析（Metatranscriptome Sequencing） 是指针对某一时间、某一特定环境中微生物群体总RNA进行提取，去除rRNA构建链特异性转录组文库，然后进行高通量测序分析，结合生物信息学方法，从转录水平研究微生物群落变化和微生物发挥功能的活性基因。
技术流程
样本处理
总RNA提取
rRNA去除
链特异性文库构建
高通量测序
生物信息分析
分析流程
基础数据处理
测序数据组装
序列组装，多样本构建非冗余集合
基因预测及表达量分析
物种与功能注释
NR、KEGG、eggNOG 数据注释
CAZy、ARDB 数据库注释
VFDB 数据库注释
物种多样性分析
主成分分析（PCA）
主坐标分析（PCoA）
非度量多维度尺度分析（NMDS）
相似性分析（ANOSIM）
置换多因素方差分析（PERMANOVA）
多响应置换过程分析（MRPP）
多元分散置换检验（PERMDISP）
物种与功能组成分析
多样本比较 UpSetR 图
物种 Heatmap 图
物种与功能差异分析
Wilcoxon 秩和检验
组间LEfSe 差异判别分析
个性化分析
根据研究需要定制分析内容
