基因帮客户又一篇论文发表于Frontiers in Microbiology(2017影响因子4.076),文章致谢中对基因帮的技术服务工作表示充分肯定

最近基因帮客户成果不断,继7月14号广东省农科院的客户发了一篇scientific reports之后,7月24日又有一篇甘肃农大客户的文章在线发表于Frontiers in Microbiology(2017影响因子4.076),恭喜老师!

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老师在论文的致谢部分对基因帮(www.genebang.com)的技术服务给予了充分肯定。

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文章标题:

RNA Sequencing Reveals that Endoplasmic Reticulum Stress and Disruption of Membrane Integrity Underlie Dimethyl Trisulfide Toxicity against Fusarium oxysporum f. sp. cubense Tropical Race 4


发表期刊


Frontiers in Microbiology(2017影响因子4.076)


客户单位:


甘肃农业大学


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本研究的核心是试图阐述一种抵抗尖孢镰刀菌的方法以及其背后的机理,后者是一种世界性分布的土传病原真菌,寄主范围广泛,可引起瓜类、茄科、香蕉、棉、豆科及花卉等100多种植物枯萎病的发生。基于之前的研究,发现韭菜对该类病原菌具有较高的抗性,并发现韭菜中的一种硫化物二甲基三硫醚:dimethyl trisulfide (DT))】可能对该病菌起主要的抑制作用


通过比较对照组与用DT处理后镰刀菌的转录组表达,该文发现了数千有显著差异的表达的基因。通过GO和KEGG富集分析,该文发现了这些差异表达基因显著富集于一些可能对该病原菌有抑制作用的功能基因集与调控通路,如与内质网(endoplasmic reticulum),糖基化,内固醇合成相关的通路。最后文章给出了一个DT抑制尖孢镰刀菌的推断模型,DT可能是通过多路径同时作用,包括糖基化阻断,活性氧富集,以及对内质网的胁迫,从而进一步照成致病菌细胞结构损伤以及细胞膜的不完整程度加大,最终导致细胞的凋亡。


部分研究结果展示



DT浓度梯度实验,DT浓度对Foc TR4生长的抑制效果:


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内固醇合成相关基因的表达谱(可能对致病菌抵抗DT有重要作用):



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qPCR验证结果:



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Foc TR4 对DT响应的机制(模型图解):



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