您的位置: 首页 > 项目池 > 项目详情

当前项目状态:招标中(仅登录的供应商用户可以投标)

项目信息
项目名称
浮萍宏基因组
技术服务需求
技术服务类型
宏基因组测序( metagenomics)
详细描述

项目背景:

项目风味两个部分

1,我们测序了不同处理下的植物和它附属DNA的序列,三个不同处理。植物为同一个基因型。每个处理测了5个样本,每个样本测了有10G左右的数据,其中50-80%左右的DNA属于微生物。

2,我们测序了同一个植物不同品系的DNA,这其中包括植物和微生物的DNA。我们总共测序了68个个体,每个样本测了4G左右的数据。其中有10-50% 的DNA属于微生物的DNA。

植物的基因组已知,很小而且组装很好。

研究目的:

目的如下:

第一部分

1,哪些微生物在不同处理种都存在的

2,哪些微生物是在不同处理下特异性的

3,哪些微生物的基因是在不同处理下特意的

4,这些微生物的种类分布如何。

第二部分

1,哪些微生物是在不同品系种都存在的

2,哪些微生物是品系特有的

3,哪些微生物的基因是在所有品系种都存在的

4,与第一部分的微生物相比,哪些是共有的?


物种名称:

Spirodela polyrhiza

实验期望:

测序已经完成。希望数据分析能在3周内完成。

样品信息(样本数量、基因数量、位点数量、分析深度、片段长度、浓度纯度要求、特殊要求):

测序是在Illumina HiSeq 4000 上完成的,paired-end,300-500bp大小。

项目标签
Metagenome sequencing
商务需求
项目预算
0.10万 - 3.00万
项目周期
1个月以内
竞价截止日期
2018-07-30
支付方式
合同发票报账
增值服务
增值服务
平台担保 平台质保
平台担保:为了让小型技术服务商、实验室、个人工作室能够得到科研用户的信任,您可以选择接受基因帮平台对您的服务和产品进行担保,平台担保会让科研用户更加有保障感。同时平台会收取20%的担保费,如您选择了平台担保,请在报价时注意盈利空间。
让专家为我设计方案 客服在线,来聊聊吧